El CRISPRa MS2 tracrRNA es un ARN trans-activador sintético diseñado para su uso en experimentos de activación génica con el sistema SAM (Synergistic Activation Mediator) basado en CRISPR. Este reactivo se combina con CRISPRa synthetic crRNA para dirigir el complejo de activación hacia el gen objetivo y promover su transcripción.

El MS2 tracrRNA es un ARN largo químicamente sintetizado y purificado por HPLC, basado en la secuencia optimizada de tracrRNA de Streptococcus pyogenes descrita por Jinek et al. Además, incorpora una secuencia aptámero MS2, que permite la interacción con el componente MS2-p65-HSF1 del sistema SAM, amplificando la activación transcripcional cuando se dirige al promotor o al sitio de inicio de transcripción (TSS) del gen de interés.

Para realizar experimentos de activación génica con el sistema SAM se requiere una línea celular estable que exprese los componentes NLS-dCas9-VP64 y MS2-p65-HSF1, junto con el MS2 tracrRNA y el crRNA específico del gen objetivo. Este enfoque permite implementar activación génica robusta y específica en células de mamífero mediante transfección de guías sintéticas.